1.税收优惠政策差异
高新技术企业主要享受的是企业所得税优惠，优惠税率由原来的25%降低为15%。
高新企业和双软企业的税收优惠政策不冲突，可以叠加享受。
2.有效期和年审要求差异
高新技术企业有效期为3年，3年复审，第6年再次认定。高新技术企业每年按照相关要求报科委备案。
软件企业实行每年年检，按照《软件企业管理办法》要求的指标和资料，每年的6月份之前办理软件企业年检。通过年检方可享受政策。
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